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閥門ORF指什麼

發布時間:2021-10-23 20:20:56

『壹』 什麼是開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF)

在構成基因的核苷酸序列中存在著一些最終翻譯成蛋白的鹼基段,每三個連續鹼基(即三聯「 密碼子」) 編碼相應的氨基酸。其中有一個起始「密碼子」--AUG/ATG和三個終止「 密碼子」,終止「 密碼子」提供 終止信號。當細胞機器沿著核酸合成蛋白鏈並使其不斷延伸的過程中遇到終密碼子時,蛋白的延伸反應終止,一個成熟(或提前終止的突變)蛋白產生。因此開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的 鹼基序列。由於擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段鹼基序列產生合適大小蛋白才出現的終止密碼子,該段鹼基序列編碼一個蛋白。 現在有很多找ORF的軟體,包括在線的,如: ORF Finding的功能 ORF Finding 被用來預測已存在的編碼區的小基因序列。它較早應於序列設計,應用優於長片斷、高質量的匹配。進而,它提供了比用標准基因編碼查詢更有用的信息。ORF Finding 把提交序列分成六個亞區,並對這六個閱讀框分別進行默認,賦予每個亞區一個確定其編碼內容的度量, 如果可能,將對每一亞區進行進一步分析。每個亞區按照已有的分類結果,被隨機提交給查找它們是否編碼 蛋白質的特定測試收集器。最後只有那些具有編碼潛能的重要區域才被報導。ORF Finding 識別是證明一個新的DNA序列編碼特定的蛋白質的部分或全部的先決條件,可用於大規模的開放式閱讀框尋找。 使用說明測試過程:當一個基因被識別、其DNA序列被解讀時,人們往往仍然無法 弄清相應的蛋白序列是什麼。這是因為在沒有其它信息的前提下,DNA序列可以按六種框架閱讀和翻譯 (每條鏈三種,對應三種不同的起始密碼子)。 ORF Finding 針對小基因序列,搜索並報導可能的蛋白質編碼區,它檢測這六個閱讀框架,並尋找以啟動子和 終止子為界限的DNA序列,符合這些條件的序列有可能對應一個真正的單一的基因產物。 ORF Finding 通過如下方式處理您的序列: ·定位六個閱讀框上的ORF候選區域 ·對每個候選區域的編碼可能性進行評估 ·如果可能性很高,就把該區域作為可能的蛋白質編碼區進行報導 編碼可能性:是通過從物種訓練模擬器收集來的統計數據確定的用。ORF Finding 進行蛋白質編碼區的預測,有三步程序。 第一步:延伸無終止密碼子的序列,把延伸的片斷定位在六個閱讀框上;它們是下一步進行 開放式閱讀框研究的候選序列。 第二步:用物種hexamer統計表來估算ORF候選區域上蛋白質編碼部分編碼蛋白質的最大可能性。 第三步:根據序列結構和區域最可能成分來計算蛋白質編碼的可能性。 這種測試利用物種的統計學原理把編碼區從非編碼區區分出來,其中包括編碼蛋白質的最大可能性的估算、3 個過程的測試 和 ORF片斷大小的確定。這種測試應用於物種的二次形式,得到一個三個自由度的 chi-square統計量,被稱為候選ORF的二次判別式。這個判別式對於編碼區趨向於取大值,對於非編碼區 趨向於小值,並被固定化,所以非編碼區獲取的值趨向於小於1。 一般通過第一步和第二步,大約61%的非編碼區域產生值小於1的二次判別式。89%的區域的期望值小於2。 經多次應用發現,5.0的結果很理想,它是介於正、誤之間的閾值。 使用方法: 首先選擇你測試的序列的來源(物種),然後直接在輸入 框內填寫您的DNA序列,進行提交即可。但輸入序列的長度不得小於50bp。 結果說明:提供最優的潛在開放閱讀框位置。通常, ORF Finding 會把您提交的序列進行檢測,然後根據閱讀框的次序(+1,+2, +3,-1,-2,-3),給出各閱讀框架的蛋白質編碼區域的 詳細信息。如果同一個閱讀框包含幾個蛋白質編碼區域的話,則這一開放式閱讀框中蛋白質編碼區域 會按照它們的起始核苷酸在該閱讀框上的鹼基位置依次給出。編碼區域的詳細信息包括: ·Numb x: 編碼區編號。從1依次增加,從此您可以知道各編碼區的相對序號和您提交的序列的總編碼區數目。 ·Predicted start、Predicted end: 預測的基因編碼區的開始、結束。是指該閱讀框的該編碼區上編碼蛋白質的核苷酸的起始和結束位置。 ·Reading frame:閱讀框。六種框架(每條鏈三種,對應三種不同的起始密碼子)中的哪一種。 ·Type:類型。說明這一蛋白質編碼區是預測出來的還是存在的。 ·ORF start、ORF end:開放式閱讀開始、結束。即這一編碼區的起始和結束。它除包括編碼蛋白質的核酸序列外,還包括調控基因、起始密碼子、終止密碼子等。 ·Spectral:吸收光譜。 該段核苷酸的吸收光譜數。 ·ORF length:ORF長度。 ·Max likelihood:最大可能性。請參考 測試過程 中的 編碼可能性。 MLE length score:最大可能性估量長度評估。即該編碼區上編碼部分佔整個ORF區的比例。 ·Quadratic discriminant:二次判別式的值。對於編碼區趨向於取大值,非編碼區趨向於取小值

『貳』 什麼是ORF

開放閱讀框(Open Reading Frame, ORF),某些人認為這是分子病理學領域中最孤獨的首位字母縮寫名詞。在構成基因的核苷酸序列中存在一些最終翻譯成蛋白的鹼基段。每三個連續鹼基,名為三聯「密碼子」——編碼相應的氨基酸(氨基酸是構成蛋白的基本單位)。有三個「密碼子」提供終止信號,也就是說,當從DNA和RNA合成蛋白鏈並使其不斷延伸的細胞機器遇到代表終止的「密碼子」時,蛋白的延伸反應終止,一個成熟(或提前終止的突變蛋白)產生。因此開放閱讀框是DNA上的一段鹼基序列,由於擁有特殊的起始密碼子和直到可以從該段鹼基序列產生合適大小蛋白才出現的終止密碼子,該段鹼基序列編碼一個蛋白。

『叄』 CO乚ORF乚中文念什麼

回答和翻譯如下:
colorful.
多彩的。
(音譯:卡樂佛。)

『肆』 多外顯子的基因的ORF包含所有的外顯子嗎還是指其中的單個外顯子

orf只是mRNA中的一段,而mRNA則由多個外顯子組成,所以不是所有,當然可能是其中某個,也可能是多個外顯子片段,或是部分的外顯子吧

『伍』 建築工程電氣圖中ORF代表什麼意思

BV-10*1.5SC25CC/AX;直徑25的線管穿10根1.5的單股銅芯線

『陸』 Cds和ORF的區別是什麼

一、功能不同

1、cds:縮短請求響應時間和網路延遲,減輕網站伺服器的負載;有效規避信用風險。

2、ORF:降低了所要通告的前綴數量,從而減少BGP路由更新數量;減輕本地路由器工作量。

二、原理不同

1、cds:在計算機上,通過此種服務使各地的Internet客戶在訪問這些網站時,可以訪問最接近本地緩存伺服器中緩存的內容;在一定期限內,買賣雙方就指定的信用事件進行風險轉換的一個合約。信用風險保護的買方在合約期限內或在信用事件發生前定期向信用風險保護的賣方就某個參照實體的信用事件支付費用,以換取信用事件發生後的賠付。

2、ORF:將本地配置的BGP(邊界網關協議)前綴過濾器「推送」給遠程對等體,以便遠程對等體將收到的過濾器應用為自己的又一出站過濾器。

三、特點不同

1、cds:CDS的主要特點是高杠桿性。與購買債券不同,前期投資CDS不需要或僅需要少許資金投入,原因之一就是保護買方僅需要按季度支付票息,而保護賣方只需要保證金賬戶(margin account)。 CDS的買賣不受債券供應的限制。因此在市場上CDS的名義本金遠遠要超過標的資產的本金。

2、ORF:ORF識別包括檢測這六個閱讀框架並決定哪一個包含以起始密碼子和終止密碼子為界限的DNA序列而其內部不包含起始密碼子或終止密碼子,符合這些條件的序列有可能對應一個真正的單一的基因產物。

『柒』 asco閥門銘牌中英文什麼意思

II2D ExtDA21 IP65和II2G ExdIIB+H2指的是用在粉塵和氣體的防爆等級以及防護等級,T amb/T cable這個指的是不同的溫度組別所適用的溫度范圍,MEDIUM指的是介質,bar指的是工作壓力 ,ORF指的是通經,VOLTS指的是電壓, HZ指的是頻率,WATTS指的是功耗,pipie指的是介面尺寸,線面那個是型號。

『捌』 基因的cds和orf的區別

CDS特指cDNA上面可以編碼蛋白質那段序列。
ORF是指某一段DNA上面有可能編碼蛋白質的序列。

『玖』 分子生物學中的CD是指什麼ORF又是什麼

CD分子是白細胞分化抗原。80年代以來,由於單克隆抗體、分子克隆、基因轉染細胞系等技術在白細胞分化抗原研究中得到廣泛深入的應用,有關白細胞分化抗原的研究和應用進展相當迅速。在世界衛生組織(WHO)和國際免疫學會聯合會(IUIS)的組織下,自1982年至1993年先後舉行了五次有關白細胞分化抗原的國際學術討論會。並應用以單克隆抗體鑒定為主的聚類分析法,將識別同一分化抗原的來自不同實驗室的單克隆抗體歸為一個分化群(cluster of differentiation,CD)。在許多場合下,抗體及其識別的相應抗原都用同一個CD序號
orf是開放閱讀框。開放閱讀框是基因序列的一部分,包含一段可以編碼蛋白的鹼基序列,不能被終止子打斷。當一個新基因被識別,其DNA序列被解讀,人們仍舊無法搞清相應的蛋白序列是什麽。這是因為在沒有其它信息的前提下,DNA序列可以按六種框架閱讀和翻譯(每條鏈三種,對應三種不同的起始密碼子)。ORF識別包括檢測這六個閱讀框架並決定哪一個包含以啟動子和終止子為界限的DNA序列而其內部不包含啟動子或密碼子,符合這些條件的序列有可能對應一個真正的單一的基因產物。ORF的識別是證明一個新的DNA序列為特定的蛋白質編碼基因的部分或全部的先決條件。

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