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加工貿易是我國對外貿易的重要組成部分和利用外資的重要方式，是推動我國對外經濟貿易持續快速發展的主要動力。加工貿易的發展促進了我國產業結構的調整，極大地促進了我國製造業的發展，對擴大就業、穩定社會做出了顯著的貢獻。但是與此同時，我國加工貿易發展中還存在很多問題，特別是由於原產地規則的差異，也加劇了與美國的貿易摩擦。�十六屆三中全會通過的《中共中央關於完善社會主義市場經濟體制若干問題的決定》提出的「繼續發展加工貿易，著力吸引跨國公司把更高技術水平、更大增值量的加工製造環節和研發機構轉移到我國，引導加工貿易轉型升級」，為我國加工貿易的發展指明了方向。因此，要採取積極措施，在大力發展加工貿易的同時，促進加工貿易轉型升級。�
要採取積極措施，發展加工貿易，著力吸引跨國公司把更高技術水平、更大增值量的加工製造環節和研發機構轉移到我國，引導加工貿易轉型升級。 �
(一)加強和改善加工貿易的審批管理�
1.完善加工貿易業務的審批制度。在目前分級審批制的基礎上，適當擴大地(市)和縣(市)級加工貿易審批權。對實行總量平衡管理的棉花、食糖、植物油、羊毛、天然橡膠、原油和成品油等商品的加工貿易業務，有條件的地區，也可以將審批權下放市一級。�
2.適度放寬加工貿易企業審批條件。減少程序，簡化審批手續。根據中西部地區加工貿易不發達現狀，適當放寬條件，鼓勵中西部地區企業開展加工貿易業務。�
3.嚴把加工貿易業務(合同)審批關。嚴格按照海關總署、發展改革委制訂的單耗標准來審批加工貿易，對尚沒有全國統一單耗標準的，加工貿易審批機關要嚴格審核企業所申報的單耗，徵求行業主管部門和主管海關的意見後予以審批，海關憑加工貿易審批機關簽發的《加工貿易業務批准證》予以備案。�
4.規范加工貿易批准證的時限。經營企業須按《加工貿易業務批准證》規定的期限加工、返銷製成品並辦理核銷手續。如因客觀原因確需延長製成品返銷期限，須在規定的製成品返銷期限內報原審批機關批准，海關憑批件辦理延期手續。�
5.提高加工貿易審批效率。進一步完善「金關工程」，實現加工貿易各有關管理部門之間的聯網，以更精確、更便捷、更經濟的管理減少交易成本，提高企業和產品的競爭力。充分利用電子化管理將有效地在政府部門管理現代化中避免重復建設，實現資源共享，促進加工貿易發展。�
6.對敏感的配額許可證商品、有污染的商品、國際市場容量有限並易沖擊我國一般貿易出口的商品等限制類商品，其加工貿易的審批要更加嚴格。�
(二)科學規范加工貿易企業的分類管理�
1.根據機構改革後的新情況，重新調整和完善「加工貿易部際聯席會議」制度。建議由商務部、發展改革委、海關總署、財政部、國家稅務總局、中國人民銀行、外匯管理局、中國銀行組成加工貿易部際聯席會議，定期通報情況，研究政策，共同做好加工貿易的管理工作。今後，各省市也應建立相應的加工貿易聯席會議制度，就各種情況互相定期通報。�
2.科學界定加工貿易企業分類標准。放寬對加工貿易企業違規的界定條件，對一般技術性違規的不應做為評定企業類別的依據，對輕微違規，處罰金額不大(可加大到5萬元以內)的違規行為，也不應做為類別評定紀錄。對無走私記錄、從事高新技術產業的大型加工貿易企業，應盡可能使之在沒有C類、D類企業違規嚴重的情況下進入A類行列。�
3.建議將違規次數占其進出口報關貨物申報單票數的比例，做為企業分類考核指標。凡加工貿易企業一年內違規少於2次，或違規次數占其報關單票數的比例低於規定的標准，同時符合海關關於企業分類的其它規定，將其劃入B類或A類企業管理。�
(三)優化加工貿易產業結構，引導加工貿易良性發展�
1.積極參與全球產業分工，大力發展加工貿易。我國沿海地區投資環境和工業基礎都有了明顯改善，為吸收跨國公司的進入創造了有利條件，應該引導外資逐步從傳統產業轉向新興產業，傳統產業和勞動密集型產業則應逐步引向內地，並根據自身需要適當發展部分勞動密集型產業。�
2.採取措施推動國內相關產業升級。從積極參與全球分工的角度看，要盡快調整國內相關政策，充分發揮加工貿易對國民經濟的帶動作用。�
3.大力發展並不斷提高勞動密集型產業的檔次。由於我國勞動力資源豐富，在一個相當長的時期內，仍要繼續大力發展勞動密集型產業，同時促進勞動密集型產業結構升級、提高檔次。�
4.運用市場經濟手段和國際通行做法，提高加工貿易產品國產化率。有關部門要盡快研究相應的對策，對於採用國產料件替代進口料件的加工貿易，可在一定程度上減免部分稅收，刺激企業的積極性。�
5.引導加工貿易向高新技術產業發展。建議增加外商投資產業指導目錄中的高新技術產業領域，將所有高新技術產業列入鼓勵類高新技術產業之中，進口關鍵設備零部件和軟體技術享受免徵關稅和增值稅待遇。簡化高新技術產品加工貿易的相關手續，通過資信評估，使大多數高新技術產業的出口加工企業都能劃入A類和B類。拓寬高新技術企業融資渠道，建議設立高新技術產業基金，給予高新技術產業的加工貿易項目以重點支持。提高自主開發能力，走引進、消化吸收與自主創新相結合的路子。高新技術企業要加快新技術引進步伐，跟蹤本行業世界先進技術水平。鼓勵外商投資的高新技術企業在我國設立研究開發中心(R&D)，提高我國科研水平。�
(四)大力推進中西部地區加工貿易發展�
1.加快基礎設施建設，建立良好的加工貿易發展環境。利用多種投資方式，改善中西部的基礎設施，盡快修築交通運輸干線，打通通往國際和我國東部沿海的陸路、水路和空中通道，加快電信基礎設施建設的步伐。改善對外商投資企業的管理和服務，加強投資軟環境建設。�
2.根據中西部地區的區位優勢，有針對性地制定發展出口優勢產業。培育和形成新的外經貿增長點，建立以水力、礦產等資源開發為核心的礦產品加工、農產品加工、能源加工，發展旅遊業和邊境貿易。要大力引進高新技術，加快老工業基地改造，增強對資源性產品的深加工和精加工能力，發展高附加值的出口商品，使資源優勢轉化為開拓國際市場、擴大出口的優勢。進一步辦好國家級經濟技術開發區和加工區。選擇部分科技實力強的中心城市，建立以高新技術為主的出口加工區。�
3.運用區位優勢，發展面向中亞、南亞等出口的加工工業。積極開展同周邊國家的經濟技術合作，通過經濟紐帶維護我國中西部地區在周邊國家的運輸通道。�
4.中西部地區發展加工貿易，要取得突破和更大發展，不能簡單地照搬照抄沿海地區的做法。必須解放思想，求實創新，因地制宜，發揮自身獨特優勢，採取新的思路、新的模式和更加積極有效的措施，進一步擴大對外開放。�
5.加快經貿人才培養和引進。外經貿人才的缺乏和開放意識的相對滯後，是制約中西部地區外經貿和社會經濟發展的重要因素。為此，首先要加快發展中西部地區科學教育事業，加快外經貿人才培養，造就一批業務精、懂經營、善管理的開放型人才，為西部大開發和發展外經貿事業提供智力支持。�
(五)妥善處理加工貿易內銷問題，減少對國內產業沖擊�
1.嚴格控制加工貿易保稅進口料件內銷。加工貿易保稅料件內銷，必須符合國家規定條件。嚴厲打擊利用加工貿易保稅料件內銷進行走私、牟取暴利的違法行為。�
2.規范對加工貿易內銷料件的處理。對不屬於進口配額許可證或登記管理的加工貿易進口料件內銷，海關根據《加工貿易保稅進口料件內銷批准證》，在依照國家有關規定對進口料件補征稅款及稅款利息後，辦理加工貿易登記手冊的核銷手續。對屬於進口配額許可證或登記管理的加工貿易進口料件內銷，如經營企業能夠在規定的核銷期內提交相應的一般貿易進口許可證或登記證明，海關按規定辦理加工貿易手冊的核銷手續，如經營企業不能按期提交相應的一般貿易進口許可證或登記證明，海關除按規定補征稅款及利息外，同時按進口料件案值處以等值以下、30%以上的罰款，方予辦理加工貿易登記手冊的核銷手續。�
3.加大對加工貿易違法內銷的處罰力度。對未經海關許可，擅自轉讓、抵押、調換加工貿易保稅料件或成品的，對有關保稅料件數量短少且不能提供正當理由或有關紀錄不真實的，以及三次以上走私的企業，要依法進行處罰，規范加工貿易秩序，盡量避免加工貿易進口料件內銷對我國民族產業的不利影響。�
(六)發展出口加工區，規范加工貿易管理�
設立出口加工區是我國加工貿易監管制度的一項重大改革。我國出口加工區的設置，將改變現有加工貿易「遍地放羊式」為「圈養式」的集中規范管理。發展出口加工區，有利於我國加工貿易監管，解決長期以來海關對加工貿易企業難以進行有效監管和手續繁雜的矛盾，促進加工貿易的健康發展。�
1.進一步規范出口加工區貨物進出的監管。加強出口加工區與境外之間進出貨物的監管。加強對出口加工區與區外之間貨物進出的監管。�
2.切實落實加工貿易深加工結轉保稅監管政策，提高加工貿易產品國產化率。�
3.進一步完善出口加工區的管理。根據我國的實際情況，相應完善出口加工區的服務功能，在對加工貿易業務有效監管的基礎上，進一步放寬政策，簡化企業的手續。�
4.積極興辦高新技術產業出口加工區。一方面，引導高新技術產業的加工貿易企業逐步向我國新設立的出口加工區內集中，形成高新技術產業群，提高產業配套能力，擴大整體優勢。另一方面，建議在北京、天津、上海、廣州、深圳等高新技術產業已有基礎且具有發展潛力的開發區內試辦規范的高新技術產業出口加工區。�
(七)進一步改革和完善現行加工貿易管理體制�
為適應我國加入WTO和進一步擴大改革開放新形勢，進一步改革和完善現行加工貿易管理體制。在堅持保證金台賬制度的基礎上，加強海關監管的有效性。引導加工貿易到指定區域內保稅監管，對於指定區域外實行先征後退或銀行擔保的國際通行做法。充分利用信息技術的發展，採用高科技手段，對加工貿易全過程實施電子網路管理。�
1.積極引導加工貿易企業向實行封閉管理的保稅區、出口加工區、保稅集團、保稅工廠轉移，對指定區域內的加工貿易由海關實行保稅監管，在完善現行監管辦法的基礎上實行規范化的管理。經過一定時期過渡後，指定區域外只允許採取保稅工廠、保稅集團的形式。要進一步強化保稅區和出口加工區等指定區域的保稅加工功能，放開加工貿易的產品范圍，簡化手續，相應強化封閉式管理。�
2.要採取有力措施，完善加工貿易保證金台賬制度。為實施「實轉」有困難的加工貿易企業尋求多種擔保或抵押，經海關認可的，可以暫免繳納有關稅賦，待加工生產成品出口後予以核銷。如果經營單位在規定時間沒有出口或違規內銷，海關將擔保金或擔保物抵交稅款或緩稅利息。�
3.嚴格加工貿易深加工結轉管理。利用計算機異地報關系統和加工貿易分冊，規范加工貿易的異地加工以及深加工結轉管理。�
4.引入加工貿易業務風險管理機制。目前，要在堅持台賬制度的基礎上，引入風險管理機制，加大對加工貿易保稅進口料件的監管力度。�
5.創造條件，逐步使保稅區向自由貿易區發展。根據我國保稅區發展情況，建議選擇上海、天津和深圳等建立比較早、發展比較快、規模比較大主要港口城市保稅區，率先建立綜合型自由貿易區，實現鄧小平同志曾多次提出的「在內地再創幾個香港」戰略構想。�
(八)建立完善的加工貿易政策促進體系�
1.統籌考慮我國出口退稅政策的基礎上，統一各種貿易方式下我國國產料件出口的退稅率，以比較合理的稅收優惠，引導加工貿易更多地採用國產料件，促進我國原材料、零部件、設備等出口。建議國家建立進口稅收擔保基金，通過銀行或保險公司對進行封閉式加工的企業提供稅收擔保，既確保企業正常運作，又確保國家利益免受損失。�
2.在對外經貿政策上，進一步下放進出口經營權。對從事加工貿易的生產企業放開加工貿易經營權。�
3.將加工貿易的發展納入國家產業政策的范疇，以確定是否符合國家產業政策，有利於國內經濟和產業發展。對符合條件的，頒發批准證書，准予加工。加快制訂各類加工產品的耗料標准，並根據生產工藝和技術的改進適時進行調整。�
4.加強各職能部門間的協調，提高服務效率。在積極貫徹國家有關加工貿易的各項法律、政策、規章制度的前提下，進一步簡化手續，提高效率，增加透明度，為守法經營者提供最大限度的便利，促進加工貿易的正常發展。�
(九)積極推進我國境外加工貿易的發展�
境外加工貿易是適應經濟全球化、擴大出口的一種經濟貿易方式，是我國海外投資的組成部分。與我國的一般貿易相比較，境外加工貿易的社會效益更大。它不僅真正實現了擴大商品出口的目的，而且還帶動了技術、勞務以及服務貿易的出口。通過境外加工貿易，可以繞過國外貿易壁壘，增強我國產品的競爭能力，擴大銷售。�
1.結合我國產業結構調整和國有企業改革，制定我國開展境外加工貿易的行業政策。對於各類行業開展境外加工貿易的規劃，要有計劃，有步驟，分期分批地向發展中國家轉移我國的成熟產業和多餘生產力，擴大我國成套設備和原材料的出口。�
2.建議對我方做為境外加工生產自用的機械設備、器材的出口，實行不征不退政策；為鼓勵擴大生產規模，允許對境外加工貿易企業免徵所得稅，將其3年內所獲利潤充實資本金。
3.加快國有商業銀行改革，拓寬服務領域，在保證國有資本安全的情況下，按市場經濟的規則為我國境外加工貿易企業提供優質的服務。為了解決我國境外加工貿易在資金短缺方面的問題，可以考慮在監管條件成熟的情況下，讓我國境外加工貿易企業在海外發行股票，籌集資金。�
4.研究建立境外投資風險保障機制，充分發揮保險政策對境外加工貿易促進作用。研究建立境外投資風險保障機制，為包括境外加工貿易項目在內的境外投資提供風險保障。在風險抵押方面，盡快出台相應的政策，建立有效的風險評估、財產評估體系，規范抵押制度，為我國境外加工貿易企業創造良好的經營環境。�
5.簡化境外加工貿易業務的審批程序。建議對境外加工貿易企業的審批進行適當調整。對個體經營企業或者合資企業進行境外加工貿易，可實行登記制；對部分國有企業，可根據企業的具體情況區別對待，對那些經營管理不善的國有企業不能到境外從事加工貿易。�
6.加強商會、行業協會的協調和服務。充分發揮我國進出口商會、行業協會作用，對我國開展境外加工貿易的企業、行業進行協調。同時為企業提供各種信息服務。�
7.加強監管，防止國有資產流失。要建立健全境外國有資產的保障和責任法規，理順國內企業和境外企業的關系，並加快海關、稅收、外匯管理等相關法規的建設，使我國的境外投資達到為國內經濟建設服務的目的。