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做逆轉錄用什麼儀器

發布時間:2023-07-05 01:14:32

① 熒光實時定量PCR要購買哪些試劑和材料

如果你想做熒光定量PCR的根據實驗思路來說應該需要一下試劑和儀器
1.模板提取(一般為RNA):Trizol、氯仿、異丙醇、無水乙醇、DEPC處理水

2.模板濃度測定:分光光度計或NanoDrop

3.逆轉錄:逆轉錄試劑盒(或者一步法試劑盒),這一步可以用普通PCR做,也拆團旁可以用水域做。旅橡

4.熒光定量PCR試劑:通常有用SYBR Green Mix做的,但是這里建議你用EvaGreen做,靈敏度和平行性都要好於SYBR Green,並且或冊如果你那是ABI或者Stratagene的PCR如果用SYBR Green還需要加一步Rox很麻煩。

5.其他:除了以上的那些還需要離心管、PCR管或板(Axygen反應比較好)、移液槍等,暫時就想到這么多。

② ABI 7500 PCR儀可以做逆轉錄嗎

可以,只要能夠滿足精確的溫度控制就可以。根據所用逆轉錄酶的反應溫度,選擇37C,42C或者50C直接進行逆轉錄反應就可以了。所以PCR儀沒有任何問題的。

③ PCR儀器的使用方法

1目的 </B>保證GeneAmp 7000型熒光定量PCR儀的正常使用。 2 該SOP變動程序 </B>本文件的變動,可由任一使用該文件的工作人員提出,報經室技術負責人,由季度組長會議決定。如通過則公布實行。 3 適用范圍 </B>GeneAmp 7000型熒光定量PCR儀。 4 使用方法 </B>⑴依次打開電腦顯示器和電腦主機電源開關,進入Windows 2000界面。 ⑵接著打開PCR儀電源開關,預熱5分鍾。 ⑶按需要在電腦上設定一個新的運行版面和程序。 ⑷推開滑門,將樣品放入樣品槽內,關上儀器滑門。 ⑸運行程序,在反應結束後按Save鍵儲存實驗結果。 ⑹關閉PCR儀電源開關。 ⑺分析實驗結果;發放臨床報告。 5 注意事項 </B>⑴儀器應放置在水平堅固的平台上,外界電源系統電壓要匹配,並要求有良好的接地線。 ⑵環境溫度保持在23℃左右,濕度保持在60%左右。 ⑶儀器應配備功率≥3000W的穩壓器。 ⑷儀器應定期清潔維護。 ⑸儀器使用時應嚴格遵守上述使用步驟。 6 維護方法 </B>6.1微軟Windows 2000操作系統的維護 </B>硬碟驅動器每月29日運行一次碎片清除程序,使用Norton Utilities或類似軟體。現以Norton為例: ①放入Norton Utilities光碟,運行安裝(Setup)文件。 ②安裝完後取出Norton Utilities光碟,重新啟動計算機 ③運行Norton Utilities軟體,並啟動其清理碎片/優化程序。 ④運行完成後,檢查以確信無嚴重錯誤記錄,退出Norton Utilities。 ⑤以後每次運行Norton Utilities軟體中的清理碎片/優化程序就行了。 6.2 7000 PCR擴增儀的維護 </B>1.樣品槽的清潔 樣品槽每月29日進行一次清潔,如出現樣品槽污染情況則隨時清潔。 操作方法: ①運行25℃HOLD程序使樣品槽溫度達到室溫。關閉儀器,等待10分鍾。 ②從樣品槽移去樣品架。 ③在樣品槽中加入少量95%乙醇,用棉簽擦洗反應孔。 ④用干棉簽吸干乙醇。 ⑤向里推動滑門,鎖住,使樣品槽升溫到50℃,以蒸發掉多餘的乙醇。 2.熱蓋的清潔 熱蓋每月29日進行一次清潔,如有需要隨時進行。 ①運行25℃HOLD程序使樣品槽溫度達到室溫。關閉儀器,等待10分鍾。 ②逆時針旋轉GeneAmp 7000光源檢測器頂部旋鈕。向後推GeneAmp 7000光源檢測器至滑軌距離的大約1/3處。 ③GeneAmp 7000光源檢測器滑軌上有缺口。從這些缺口垂直抬起GeneAmp 7000光源檢測器,小心側放於儀器頂蓋上。不要從儀器取走熱蓋。 ④用濕潤的鏡頭紙清潔加熱蓋,待干。 ⑤將GeneAmp 7000光源檢測器重新安裝回滑軌。 6.3 GeneAmp 7000光路系統的維護 </B>1.調准ROI參照條 調准ROI參照條在儀器更換鹵素燈、儀器定期校準或儀器維修後進行。不得由一般實驗人員進行該項操作。 ①推開滑門,在樣品槽中放入熒光檢測板。 ②GeneAmp 7000儀器滑門向前滑移蓋住樣品槽,並關緊。 ③從Start菜單或桌面點選運行GeneAmp 7000 SDS管理軟體。 ④積分時間從512ms開始,用位置調整點,調節ROI的高度與右邊線。 ⑤逐漸增加積分時間,直到可以看到至少四個塊(約4096ms)。 ⑥調整最左側位置調整點。 ⑦減少積分時間到1024ms,調整上方與底部的位置調整點。 ⑧減少積分時間以便最右側塊可見但未飽和(約512ms),調節最右側位置調整點。如有需要用右上角拖動點調整圖象的傾斜度(以左上角為中心旋轉)。 ⑨調節後的參照條寬度必須在ROI參照塊間有小空隙。 2.校正ROI光路 ROI光路校正每月29日進行一次,以便確信結果仍然是優化的。 ①推開滑門,在樣品槽中放入熒光檢測板。 ②GeneAmp 7000儀器滑門向前滑移蓋住樣品槽,並關緊。 ③從Start菜單或桌面點選運行GeneAmp 7000 SDS管理軟體。 ④點選Show ROI復選框。每個樣品孔周圍出現一藍色橢圓圈。 ⑤點選Show Saturation復選框。 ⑥設定積分時間為1024ms;打開鹵素燈和光閘。 ⑦點擊LIVE按鈕獲取圖象,然後在任何地方左擊停止。獲取中等程度未飽和圖象(無紅色圖象)。 ⑧從Edit菜單中選擇Calibrate ROIs每個孔都會選取合適的ROI,確定96孔都被藍色橢圓圈正確界定。 ⑨圖象太亮太暗都會出現錯誤信息,相應增加或減少積分時間,並重復上述第8步直到無錯誤信息出現。 ⑩檢查孔ROI位置,所有孔信息都應包含在96個ROI橢圓圈中。如果沒有,重復8和9步。 3.檢查樣品槽的熒光污染 檢查樣品槽的熒光污染每月29日進行一次,如有需要隨時進行。 ①開啟GeneAmp 7000型熒光定量PCR儀電源。 ②從Start菜單或桌面點選運行GeneAmp 7000 SDS管理軟體。 ③從樣品槽中移去反應板。GeneAmp 7000儀器滑門向前滑移蓋住樣品槽,並關緊。 ④單擊New Document建立一個新的GeneAmp 7000文件 ⑤點擊instrument中的catibrate顯示ROI inspector窗口 ⑥把Exposure Time調到最大,把Capture image From調到最敏感的FiterB點,單擊Snapshot獲取圖象。 ⑦減少積分時間,改變Capture image From中的A,B,C,D單擊Snapshot 觀察96孔中背景熒光。如孔有顯著熒光則表示該孔存在熒光污染。 ⑧按照樣品槽的清潔程序清洗樣品槽。 4.更換鹵素燈 儀器使用大約2000小時後應更換鹵素燈。 ①關閉儀器,冷卻15分鍾。 ②將樣品板放入儀器樣品槽,關閉滑門。在儀器的頂部向上打開燈艙門。 ③擰下固定燈罩的螺絲,將燈罩向前滑移,使其從設備上取下。 ④將舊燈泡向前滑移,使其從夾狀支架上取下,並將燈泡從燈座上拔下。 ⑤把新燈泡尾部的插桿插入燈座上的插孔,使二者連接起來。 ⑥使燈的長軸與儀器前向平行(即豎直於地面),將新燈泡滑回燈位。 ⑦在燈艙門處於打開狀態下,打開儀器,確證在儀器運行時燈也能打開。 ⑧蓋上燈罩,擰緊螺絲,關上燈艙門。 ⑨若新鹵素燈不工作,GeneAmp 7000電源保險絲可能有問題。 7 校準 </B>GeneAmp 7000型熒光定量PCR儀為復雜精密儀器,其校準工作需由專業工程師進行。除與儀器廠家達成協議定期校準以外,以實驗判斷儀器校準狀態也可為何時進行儀器校準提供信息。 ⑴通過對室內質控圖的分析,我們可以及時發現系統誤差的出現。經過分析排除了試劑和人員誤差後,應懷疑是否儀器出現了檢測偏差需要校準。此時進行儀器狀態效驗實驗確定是否需要進行儀器校準。 ⑵儀器狀態效驗試驗 ①使用標准化試劑作為效驗試劑。 ②在儀器處於校準狀態下,由固定人員用標准化試劑對102、103、104、106標准品進行擴增實驗。該實驗在兩個月內應進行20次。分別計算標准曲線的斜率、截距、相關性的控制限。 ③每年6月、12月由固定人員進行上述實驗,觀察標准曲線的三個參數是否處在控制范圍和102標准品是否檢出。 ④當102標准品未檢出、標准曲線的三個參數超出控制范圍或僅出現後者時,先排除實驗的人員、試劑因素,再重復實驗。如結果依然,聯系廠家立即進行儀器校準。 ⑤當僅有102標准品未檢出時,檢查實驗全過程。再次上機檢測102標准品 兩枚。仍未檢出聯系廠家進行儀器校準。 ⑥儀器經過校準後,重復該實驗。結果歸入儀器檔案。標本前處理標准操作程序 </B>1 目的 </B>保證標本處理標准化、規范化,使不規范操作因素對實驗結果造成的影響減至最小。 2 該SOP變動程序 </B>本文件的變動,可由任一使用該文件的工作人員提出,報經室負責人決定。如通過則公布實行。 3 適用待處理標本范圍 臨床基因擴增實驗室現行檢測項目。 4 標准操作程序 4.1 DNA血清類(例如HBV) </B>⑴雙手戴上手套,從冰箱取出標本,將驗單和試管依次編號,收起驗單,棄去手套。 ⑵雙手換上新手套,用鑷子(夾取滅菌物品專用)取出1.5ml離心管,對應標本編號,置於離心管架上。 ⑶將移液器調到50�0�8l,先吸取50�0�8lDNA提取液加入到編好號的離心管中。然後吸取50�0�8l血清,加入離心管中混勻,注意每吸取一份血清標本應更換一次槍頭。處理全部標本,然後將離心管插到水浴板上,用鑷子放入水浴鍋,沸水浴10分鍾。 ⑷水浴完成後用鑷子將水浴板取出,轉至4℃靜置8~12小時,然後10000轉 5分鍾離心,取上清液2�0�8l點樣上機。 ⑸收拾檯面至准備狀態。 4.2 RNA血清類(例如HCV) </B>⑴雙手戴上手套,從冰箱取出標本,將驗單和試管依次編號,收起驗單,棄去手套。 ⑵雙手換上新手套,用鑷子(夾取滅菌物品專用)取出0.5ml滅菌離心管,對應標本編號,置於離心管架上。 ⑶先用5~40�0�8l的移液器,吸取10�0�8lRNA提取液A加入到編好號的離心管中,再用40~200�0�8l的移液器吸取50�0�8l 血清加入,最後用200~1000 �0�8l移液器加入200 �0�8lRNA提取液B,在震盪器上震盪混勻,冰上放置5分鍾,然後6000轉1分鍾離心。 ⑷去上清,留沉澱。加入450�0�8l 用DEPC水配製的75%的預冷乙醇洗滌沉澱,然後6000轉1分鍾離心,去上清。相同方法再洗一次,吸幹上清,65℃10分鍾烘乾。 ⑸給烘乾的沉澱中加入18 �0�8l的反應液I,混勻,再加入2 �0�8l逆轉錄酶,充分混勻,瞬時離心(3秒),放入溫箱,37℃45分鍾逆轉錄。 ⑹逆轉錄後95℃3分鍾高溫滅活,瞬時離心(3秒),取5 �0�8l上清立即點樣上機。 ⑺收拾檯面至准備狀態。 4.3 分泌物類(例如CT) </B>⑴雙手帶上手套,從冰箱取出標本,將驗單和試管依次對應編號,收起驗單,棄去手套。 ⑵雙手換上新手套,用鑷子(夾取滅菌物品專用)取出1.5ml離心管,對應標本編號後,置於離心管架上。 ⑶用鑷子擰下全部試管蓋並依次置於實驗檯面上,試管對應放置於試管架上。 ⑷向每隻試管中緩慢加入1ml無菌生理鹽水。 ⑸用左手取試管於旋渦振盪器上充分振盪。 ⑹將試管中的洗脫液全部轉至相應離心管。 ⑺將試管和離心管分別放回試管架和離心管盒中前一排對應位置,並用鑷子將管蓋對號蓋回,把試管架放回冰箱。 ⑻雙手換上新手套,用左手將離心管全部配平,按順序置於離心機中相應位置,以 12000轉離心5分鍾。去上清,沉澱再加1ml生理鹽水打勻,15000 rpm離心5分鍾。(如超過12管,則需分批進行)。 ⑼離心完畢後,左手取出離心管,傾倒上液,再瞬時離心,右手取移液器將管內殘液吸盡,只留下沉澱。如無明顯肉眼可見沉澱,則可在管內留下約50�0�8l液體。 ⑽依次向管中各加入50�0�8lDNA提取液,此時移液器應與管壁約成30度角,吸頭抵至沉澱上方靠管壁處,來回抽吸,將沉澱與DNA提取液混勻。 ⑾將加入DNA提取液的標本沸水浴10分鍾。 ⑿將沸水浴後的標本放置至室溫,並將其放入4℃冰箱中6~8小時保證充分裂解。 ⒀離心標本10000 轉5分鍾。 ⒁換上新手套,取上清液2�0�8l點樣上機。 ⒂收拾檯面至准備狀態。 4.4痰液類(例如TB) </B>⑴取晨痰加入4倍體積4%氫氧化鈉待其充分液化(30分鍾),液化過程中,振盪2~3次,如痰液粘稠,可延長液化時間。 ⑵取1 ml消化液加入離心管,10000轉離心5分鍾 ⑶棄上清留沉澱,加入1ml生理鹽水洗滌,10000 轉 5分鍾離心。 ⑷重復⑶操作,留沉澱,加入50�0�8lDNA提取液,混勻。 ⑸沸水浴10分鍾,4℃放置8~12小時。 ⑹10000 轉5分鍾離心,取上清2�0�8l點樣上機。

④ 要做(mRNA)RT PCR,需要的儀器有哪些

首先,RT不是證明RNA有無表達的很好方法,RT批不出來會有很多原因,並不僅僅是沒有模板。建議你做northern。
做RT需要
1,很乾凈整潔的實驗環境,RNA提取對操作環境的要求很高。
2,電動組織分散儀(IKA公司的T10那種)或研缽+液氮或玻璃組織研磨器,以上提取效果遞減。
3,1.5ml管冷凍離心機。
4,移液槍1ml、200ul、10ul一套,最好專用。
5,紫外分光光度計、石英狹縫比色皿。
6,核酸電泳儀、電泳槽(電泳槽最好專用)
7,RNase
free的各式槍頭、1.5ml離心管;RNase
free的雙蒸水。
8,如果樣品不會立即進入下一步實驗,建議具備超低溫冰箱。

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