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用什麼儀器進行酶切

發布時間:2022-09-25 12:33:53

❶ 酶切的步驟

一、實驗材料准備
1. 材料:質粒DNA。
2. 試劑:限制性內切酶、ddH2O。
3 . 儀器:微量移液槍,離心機,水浴鍋, 電泳儀,紫外透射觀測儀。
二、單酶切 1. 在1.5 mL滅菌離心管中依次加入:(1)質粒DNA:X μL(約1 μg)。(2)限制性內切酶:1 μL(約10 U)。(3)10×buffer:2 μL。(4)ddH2O:補足20 μL。
2. 混勻,做好標記。3. 37℃水浴1-3 h。4. 70℃水浴10 min中止反應。5. 電泳檢測酶切效果。
三、雙酶切 1. 在1.5 mL滅菌離心管中依次加入:(1)質粒DNA:X μL(約1 μg)。(2)限制性內切酶1:1 μL(約10 U)。(3)限制性內切酶2:1 μL(約10 U)(3)10×buffer:1或2 μL。(4)ddH2O:補足20 μL。
2. 混勻,做好標記。3. 37℃水浴1-3 h。4. 70℃水浴10 min中止反應。5. 電泳檢測酶切效果。四、結果與分析 假若一種酶在環狀質粒DNA中只有一個酶切位點, 且酶切徹底,紫外燈下檢測電泳結果,則單酶切應為一條帶, 而雙酶切則為兩條帶。如果條帶數目多於理論值,那麼有可能是酶切不完全。如果酶切結果與酶切前的質粒條帶一樣(超螺旋、線性和開環三條帶),則說明質粒完全沒有被切開。

❷ 常用的酶切有哪些方法

常用的酶切方法有單酶切、雙酶切和部分酶切等幾種。(1)單酶切法:這是用一種限制性內切核酸酶酶切DNA樣品。若DNA樣品是環狀DNA分子,完全酶切後,產生與識別序列數(n)相同的DNA片段數,並且DNA片段的兩末端相同。若DNA樣品本來就是線形DNA片段,完全酶切的結果,產生n+1個DNA片段數,其中有兩個片段的一端仍保留原來的末端。

(2)雙酶切法:這是用兩種不同的限制性內切核酸酶酶切同一種DNA分子的方法。DNA分子無論是環狀DNA分子,還是線形DNA片段,酶切結果,DNA片段的兩個黏性末端是不同的(用同尾酶酶切除外)。環狀DNA分子完全酶切的結果,產生的DNA片段數是兩種限制性內切核酸酶識別序列數之和。線形DNA片段完全酶切的結果,產生的DNA片段數是兩種限制性內切核酸酶識別序列數之和加1。

(3)部分酶切:部分酶切指選用的限制性內切核酸酶對其在DNA分子上的全部識別序列進行不完全的酶切。導致部分酶切的原因有底物DNA的純度低、識別序列的甲基化、酶用量不足、反應時間不夠以及反應緩沖液和溫度不適宜等。部分酶切會影響需要的DNA片段的得率。但是從另一方面說,有時根據重組DNA的需要,還專門創造部分酶切的條件,以獲得需要的DNA片段。

圖4-2:DNA酶切電泳圖

❸ 如何給一段序列增加一個酶切位點。

你可以設計帶有酶切位點的引物,對目的基因進行PCR,就可在目的基因上引入酶切位點。
步驟:引物設計(藉助軟體)——合成引物(公司合成)——PCR。
最重要的一個儀器就是PCR儀了,具體的加什麼試劑,加多少,我想樓主應該是做分子生物學,這些應該挺清楚的了。

樓主,引物一般是用軟體設計,例如Primer.5,你根據你的目的基因兩端的特點,設計合適的引物,然後在引物上再添加酶切位點 ,例如EcoRⅠ 是應用最廣泛的限制性內切酶,酶切位點和切割位點如下: 5' G↓AATTC 3' 3' CTTAA↑G 5' ,你就可以在這兩條引物上分別添加這幾個脫氧核苷酸,這不就在引物中引入酶切位點了嗎?經過PCR後引物和目的基因連在一起,酶切位點自然也連上去了。樓主,你可以根據需要,引入不同的限制性內切酶的酶切位點。

❹ 誰做過酶切質粒的實驗啊,制感受態細胞然後轉化呢求詳細過程及注意要點!

大腸桿菌電轉化感受態細胞制備
第一天: 1. 將適合菌株(如XL1-Blue, DH5α)置於LB或其他營養豐富的培養基上,在37°C下過夜培養 2. 高溫滅菌大的離心瓶(250-500ml)以備第二天搖瓶用 3. 准備幾瓶滅菌水(總量約1.5升),保存於冷凍室中以備第二天重懸浮細胞用 第二天: 4. 轉移0.2-1ml過夜培養物至裝有500ml LB(或其他營養豐富的培養基)的1-2升擋板搖瓶中 5. 37°C下劇烈振盪培養2-6小時 6. 定時監控O.D.600值(培養1小時後每半小時測定一次) 7. 當O.D.600值達到0.5-1.0時,從搖床中取出搖瓶,置於冰上冷卻至少15分鍾(需要的話這種方式可以存放培養液數小時) 8. 細胞在4°C 5000g下離心15分鍾,棄上清液(如需要,沉澱可在4°C的10%甘油中保存一兩天) 9. 用滅菌的冰水重懸浮細胞。先用渦旋儀或吸液管重懸浮細胞於少量體積中(幾毫升),然後加水稀釋至離心管的2/3體積。 10. 照上面步驟重復離心,小心棄去上清液 11. 照上面步驟用滅菌的冰水重懸浮細胞 12. 離心,棄上清液 13. 用20ml滅菌的、冰冷後的10%甘油重懸浮細胞
14. 照上面步驟離心,小心棄去上清液(沉澱可能會很鬆散) 15. 用10%甘油重懸浮細胞至最終體積為2-3ml 16. 將細胞按150μl等份裝入微量離心管,於-80°C保存
轉化方法:1. 在冰上解凍電感受態細胞添加1-10μl DNA ,冰上培育約5分鍾 2. 添加1-3μl DNA ,冰上培育約5分鍾 3. 轉移DNA/細胞混合物至冷卻後的2mm電穿孔容器(無泡)中 4. 載入P1000,准備好300μl LB 或 2xYT 5. 對電穿孔容器進行脈沖(200 歐姆, 25μFd, 2.5 千伏)(檢查時間常數,應該在3以上) 6. 立即添加300μl 的LB或2xYT至電穿孔容器中 7. 37°C下培養細胞40分鍾至1小時以復原 8. 轉移細胞至適當的選擇培養基上培養
大腸桿菌感受態細胞制備及轉化中的影響因素
1、 感受態細胞的概念
重組DNA分子體外構建完成後,必須導入特定的宿主(受體)細胞,使之無性繁殖並高效表達外源基因或直接改變其遺傳性狀,這個導入過程及操作統稱為重組DNA分子的轉化。
在原核生物中,轉化是一個較普遍的現象,在細胞間轉化是否發生,一方面取決於供體菌與受體菌兩者在進化過程中的親緣關系,另一方面還與受體菌是否處於一種感受狀態有著很大的關系。
所謂的感受態,即指受體(或者宿主)最易接受外源DNA片段並實現其轉化的一種生理狀態,它是由受體菌的遺傳性狀所決定的,同時也受菌齡、外界環境因子的影響。cAMP可以使感受態水平提高一萬倍,而Ca2+也可大大促進轉化的作用。細胞的感受態一般出現在對數生長期,新鮮幼嫩的細胞是制備感受態細胞和進行成功轉化的關鍵。
制備出的感受態細胞暫時不用時,可加入占總體積15%的無菌甘油或-70℃保存(有效期6個月)。
2、 轉化的概念及原理
在基因克隆技術中,轉化特指將質粒DNA或以其為載體構建的重組DNA導入細菌體內,
使之獲得新的遺傳特性的一種方法。它是微生物遺傳、分子遺傳、基因工程等研究領域的基本實驗技術之一。
受體細胞經過一些特殊方法(如:電擊法,CaCl2等化學試劑法)處理後,使細胞膜的通透性發生變化,成為能容許外源DNA分子通過的感受態細胞。進入細胞的DNA分子通過復制、表達實現遺傳信息的轉移,使受體細胞出現新的遺傳性狀。
大腸桿菌的轉化常用化學法(CaCl2法),該法最先是由Cohen於1972年發現的。其原理是細菌處於0℃,CaCl2的低滲溶液中,菌細胞膨脹成球形,轉化混合物中的DNA形成抗DNase的羥基-鈣磷酸復合物粘附於細胞表面,經42℃短時間熱沖擊處理,促使細胞吸收DNA復合物,在豐富培養基上生長數小時後,球狀細胞復原並分裂增值,被轉化的細菌中,重組子中基因得到表達,在選擇性培養基平板上,可選出所需的轉化子。
Ca2+處理的感受態細胞,其轉化率一般能達到5×106~2×107轉化子/ug質粒DNA,可以滿足一般的基因克隆試驗。如在Ca2+的基礎上,聯合其它的二價金屬離子(如Mn2+、Co2+)、DMSO或還原劑等物質處理細菌,則可使轉化率提高100~1000倍。
化學法簡單、快速、穩定、重復性好,菌株適用范圍廣,感受態細菌可以在-70℃保存,因此被廣泛用於外源基因的轉化。
除化學法轉化細菌外,還有電擊轉化法,電擊法不需要預先誘導細菌的感受態,依靠短暫的電擊,促使DNA進入細菌,轉化率最高能達到109~1010轉化子/ug閉環DNA。因操作簡便,愈來愈為人們所接受。
3、 感受態細胞制備及轉化中的影響因素
⑴、細胞的生長狀態和密度
最好從-70℃或-20℃甘油保存的菌種中直接轉接用於制備感受態細胞的菌液。不要用已
經過多次轉接,及貯存在4℃的培養菌液。細胞生長密度以每毫升培養液中的細胞數在5×107個左右為佳。即應用對數期或對數生長前期的細菌,可通過測定培養液的OD600控制。對TG1菌株,OD600為0.5時,細胞密度在5×107個/ml左右。(應注意OD600值與細胞數之間的關系隨菌株的不同而不同)。密度過高或不足均會使轉化率下降。
此外,受體細胞一般應是限制-修飾系統缺陷的突變株,即不含限制性內切酶和甲基化酶的突變株。並且受體細胞還應與所轉化的載體性質相匹配。
⑵、質粒DNA的質量和濃度
用於轉化的質粒DNA應主要是超螺旋態的,轉化率與外源DNA的濃度在一定范圍內成正比,但當加入的外源DNA的量過多或體積過大時,則會使轉化率下降。一般地,DNA溶液的體積不應超過感受態細胞體積的5%,1ng的cccDNA即可使50ul的感受態細胞達到飽和。
對於以質粒為載體的重組分子而言,分子量大的轉化效率低,實驗證明,大於30kb的重組質粒將很難進行轉化。此外,重組DNA分子的構型與轉化效率也密切相關,環狀重組質粒的轉化率較分子量相同的線性重組質粒高10~100倍,因此重組DNA大都構成環狀雙螺旋分子。
整個操作過程均應在無菌條件下進行,所用器皿,如離心管,移液槍頭等最好是新的,並經高壓滅菌處理。所有的試劑都要滅菌,且注意防止被其它試劑、DNA酶或雜DNA所污染,否則均會影響轉化效率或雜DNA的轉入。
⑸、整個操作均需在冰上進行,不能離開冰浴,否則細胞轉化率將會降低。
大腸桿菌感受態細胞制備及外源DNA的轉化
實驗目的
1.了解轉化的概念及其在分子生物學研究中的意義。
2.學習氯化鈣法制備大腸桿菌感受態細胞的方法。
3.學習將外源質粒 DNA 轉入受體菌細胞並篩選轉化體的方法。
實驗原理
轉化( Transformation )是將異源 DNA 分子引入另一細胞品系,使受體細胞獲得新的遺傳性狀的一種手段,它是微生物遺傳、分子遺傳、基因工程等研究的基本實驗技術。
轉化中的受體細胞: 轉化過程所用的受體細胞一般是限制性修飾系統缺陷的變異株,即不含限制性內切酶和甲基化酶的突變株,常用 RM 符號表示。
轉化方法:電擊法、 CaCl2、 RuCl等化學試劑法
感受態細胞:處理後,細胞膜的通透性發生變化,成為能容許外源 DNA 分子通過時細胞的狀態。
轉化細胞(轉化子):帶有異源 DNA 分子的受體細胞( Transformant )。
本實驗以 E.coli DH5α 菌株為受體細胞,用 CaCl2 處理受體菌使其處於為感受態,然後與 pUC18質粒共保溫,實現轉化。 pUC18質粒攜帶有抗氨苄青黴素的基因,因而使接受了該質粒的受體菌具有抗氨苄青黴的特性,用 Apr符號表示。將經過轉化後的全部受體細胞經過適應稀釋,在含氨苄青黴素的平板培養基上培養,只有轉化體才能存活,而未受轉化的受體細胞則因無抵抗氨苄青黴素的能力而死亡。
影響轉化率的因素
細胞生長狀態和密度。
轉化的質粒 DNA 的質量和濃度。
試劑的質量。防止雜菌和其它外源 DNA 的污染。
實驗儀器 離心設備
實驗試劑大腸桿菌DH5αLB培養基,0.1mol/LCaCl2溶液(預冷)氨苄青黴素pUC18質粒
實驗步驟
菌株活化:
1.用接種環直接取凍存的大腸桿菌DH5α,在LB培養基平板表面劃線,於37℃培養16小時
2.挑取一個單菌落,轉到3-5mlLB培養基中,於37℃培養3-5小時
3.將培養液全部轉到100mlLB培養基中培養2-3小時,到OD600=0.3-0.4感受態細胞制備:
4.將培養液轉入1.5ml離心管中,在冰上放置15-30min
5.4000rpm離心5min,棄上清
6.加入0.8ml預冷的0.1mol/l CaCl2,懸浮沉澱,冰上預冷10min
7.4000rpm離心5 min,棄上清
8.加入0.2ml預冷的0.1mol/l CaCl2,懸浮沉澱,即可使用。也可加入總體積15%的甘油 可-70℃長期保存
外源DNA的轉化:
9.取目的DNA加入大腸桿菌感受態細胞中,於冰上放置30min
10.於42℃水浴90S
11.冰上放置2min
12.加入800μlLB液體培養基於37培養1小時
13.將培養液均勻塗布在含Amp+的培養基平板上
14.將平板放置於37℃恆溫培養箱中培養12-14個小時,然後觀察結果
對照組
對照組1: 以同體積的無菌雙蒸水代替DNA溶液,其它操作與上面相同。此組正常情況下在含抗生素的LB平板上應沒有菌落出現。
對照組2: 以同體積的無菌雙蒸水代替DNA溶液,但塗板時只取5μl 菌液塗布於不含抗生素的LB平板上,此組正常情況下應產生大量菌落。
轉化率統計每個培養皿中的菌落數。
轉化後在含抗生素的平板上長出的菌落即為轉化子,根據此皿中的菌落數可計算出轉化子總數和轉化頻率,公式如下:
轉化子總數=菌落數×稀釋倍數×轉化反應原液總體積/塗板菌液體積
轉化頻率(轉化子數/每mg質粒DNA)=轉化子總數/質粒DNA加入量(mg)
感受態細胞總數=對照組2菌落數×稀釋倍數×菌液總體積/塗板菌液體積
感受態細胞轉化效率=轉化子總數/感受態細胞總數

❺ 用什麼酶切蛋白,可以得到大分子肽段怎樣能查到酶的酶切位點、酶切過程等

如果蛋白序列已知的話,用軟體如DNASTAR之類的都能進行蛋白酶模擬.一些在線工具如peptidecut也能使用.
不過這個是針對一級結構而言的,實際溶液中蛋白是折疊的,蛋白酶切位點很多都被掩埋,所以酶切預測不是很准確.至於酶切過程,這個機制到現在也只是一種假說.

❻ 在測序前如何進行pcr產物的酶切純化,注意我想知道的是用於測序的pcr產物酶切純化,不是用於克隆的酶切。

這種方法有比較大的局限性,要求pcr產物條帶要單一,如果有雜帶的話測序結果肯定就是一堆的套峰了。
這種方法是採用蝦鹼酶(SAP,Shrimp Alkaline Phosphatase)和外切酶I的混合溶液,來消化pcr擴增體系中多餘的dNTPs和引物,以便後面的測序。一般使用的終濃度為1ul混合溶液中,含有蝦鹼酶0.6單位,外切酶I1.2個單位,這個比例也可以自己通過試驗來調整。
一般是1ulpcr產物加2ul溶液。37度孵育15分鍾,即可除去多餘的引物以及dNTPs,然後80度,15分鍾就可以使蝦鹼酶失活。
這個方法的優點是簡單、快速、省錢、不損失樣品,缺點是對樣品要求高,如果一次純化測序結果不好還要重來,費時費力。所以現在測序公司一般都是使用膠回收試劑盒來純化,這樣雖然工作量比較大,費錢,但基本可以保證一次成功,總體看來還是省時省力的。

❼ 各位好!~~ 請問基因工程的儀器設備有哪些越詳細越好,謝謝!~~

首先,為了得到所需要的基因,需要提純目的RNA,需要的東西除了試劑盒以外,需要離心機,移液器,還要紫外分光光度儀來測濃度和純度。
得到RNA後,需要反轉錄為cDNA,然後擴增,需要PCR儀。檢查PCR的結果,需要電泳和顯像儀(紫外線或者熒光)

然後是酶切,分離,PCR儀和電泳儀,離心機

轉染細菌:水浴箱,孵箱,培養盤

擴增細菌:燒瓶,搖床孵箱

保存菌種的-80°冰箱,保存質粒的-20°冰箱

轉染,培養細胞:電轉染器,或者化學法(水浴箱)。二氧化碳孵箱

❽ 提完質粒後,可以進行PCR檢測也可以進行酶切檢測在什麼時候進行的個有什麼作用

一般先跑瓊脂糖電泳檢測是否提出了高質量的質粒,然後通過PCR檢測所提的質粒是否是目的質粒.
PCR檢測指用特異引物對目的DNA進行PCR,根據產物判斷
DNA是否含有目標序列.酶切檢測則是通過對目的DNA上已知酶切位點的酶切,根據產物片斷的大小是否與預期一致判斷目標DNA是否符合要求

❾ 如何給一段序列增加一個酶切位點。

你可以設計帶有酶切位點的引物,對目的基因進行PCR,就可在目的基因上引入酶切位點。
步驟:引物設計(藉助軟體)——合成引物(公司合成)——PCR。
最重要的一個儀器就是PCR儀了,具體的加什麼試劑,加多少,我想樓主應該是做分子生物學,這些應該挺清楚的了。
樓主,引物一般是用軟體設計,例如Primer.5,你根據你的目的基因兩端的特點,設計合適的引物,然後在引物上再添加酶切位點
,例如EcoRⅠ
是應用最廣泛的限制性內切酶,酶切位點和切割位點如下:
5'
G↓AATTC
3'
3'
CTTAA↑G
5'
,你就可以在這兩條引物上分別添加這幾個脫氧核苷酸,這不就在引物中引入酶切位點了嗎?經過PCR後引物和目的基因連在一起,酶切位點自然也連上去了。樓主,你可以根據需要,引入不同的限制性內切酶的酶切位點。

❿ PCR儀是個什麼儀器

PCR(聚合酶鏈式反應)是利用DNA在體外攝氏95°高溫時變性會變成單鏈,低溫(經常是60°C左右)時引物與單鏈按鹼基互補配對的原則結合,再調溫度至DNA聚合酶最適反應溫度(72°C左右),DNA聚合酶沿著磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互補鏈。基於聚合酶製造的PCR儀實際就是一個溫控設備,能在變性溫度,復性溫度,延伸溫度之間很好地進行控制。

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