① 請教梯度PCR設置梯度問題
在三步法PCR中,變性溫度通常設為94℃,也有98℃,溫度和時間可以參考PCR酶的說明書;延伸溫度通常設為72℃,時間根據酶的擴增效率和目的基因的長度來確定;這兩個溫度對PCR的影響不是關鍵的。但退火溫度的改變會對PCR產生很大的影響,所以梯度PCR主要是針對退火溫度而設計的。在同樣的PCR反應體系下,設置的梯度溫度為引物Tm值附近的溫度范圍,比較哪一個退火溫度能擴增出目的條帶。
反應管的放置由PCR儀的設置決定,我所使用的梯度PCR 儀是48孔的模塊,一橫排一個溫度,最多可設8個不同退火溫度,放反應管的地方裡面的溫度最高,外面溫度最低;如果是96孔的模塊,最多可設12個不同退火溫度,具體你要看說明書對於儀器的詳細說明。
② PTC200梯度PCR儀如何設置梯度
在添加步驟的時候有一個Option選項,選擇就能看到了
③ Bio-RAD PTC-200 PCR儀如何具體設置梯度pcr
編寫程序:
temp 設置溫度和時間
ramp 調整變溫速率
go to 設定循環的步驟
Gradient 設置梯度溫度
在Step 3 中選擇Gradient,下一個界面中Lower temp 輸入你所設梯度的下限溫度,Upper temp輸入你所設梯度的上限溫度,再輸入時間
注意:你輸入上限和下限溫度後,儀器會自動平分為8個梯度溫度。
④ eppendorf pcr儀的退火溫度梯度怎麼設置
設一個高的退火溫度,設一個低的退火溫度,然後會自動計算出中間每排孔的退火溫度,你只要用最低和最高的那兩個就夠了.可以打EPPENDORF的技術支持電話問具體怎麼操作.
⑤ 請問有誰知道如何使用Mx3005P(熒光定量PCR儀)設置梯度溫度
博凌科為-為你解答:我用的也是Mx3005P,不能設置梯度溫度,只能設置整體退火溫度的梯度變化,463363484,歡迎交流
⑥ 普通PCR怎麼跑梯度啊
是不同的管跑不同的溫度呢?還是同一管跑梯度?如果不通的管子,就需要梯度pcr儀了,如果是一管,你可以設置在循環的時候,每循環一次溫度遞增或者遞減0.5或者1度之內的。如果pcr連這個功能都沒有,那你就多設幾個循環,比如前10個循環50度,中間10個循環55度,後面10個循環60度,具體怎麼設置根據自己的情況。
⑦ 誰能給我介紹一下這個PCR儀,可不可以用梯度PCR ,梯度PCR 的各個參數什麼設置
這個型號做不了梯度,只能是一個溫度的。如果你有其他型號的,直接上他們的官網去下載對應型號機器的說明書,有詳細說怎麼設定梯度PCR溫度的步驟。http://www.biometra.com/thermocycler.0.html
⑧ 梯度PCR儀怎麼設置溫度循環我們用的是wealtec的SEDI G
威泰克pcr儀有中文界面的,可以先去setup裡面把language調成簡體中文,然後按照提示走就可以了。
PCR原理很簡單,就是三個步驟的循環么,首先你要在紙上打一個草稿,設計好每個步驟什麼溫度,運行多久,然後幾個循環。然後設置程序的時候,其實就是把你設計的步驟輸進去就好了。
循環的概念也很簡單,就是告訴系統,我想讓這三個步驟運行多少遍的意思,SEDI裡面內置的是GOTO函數,也就是說,當系統從左到右一步一步走,走到一個步驟如果遇到帶GOTO函數了,系統就要停下來看一下,我下一步去哪?所以GOTO函數要告訴系統回到循環中的哪一步(舉例,如果步驟1是95℃ 30s解鏈的步驟,然後步驟3是75℃延伸的步驟,那就在步驟3裡面的GOTO函數設置回步驟1),但是你不能光告訴我回哪,你還得告訴我回幾次吧?總不能每次到你這步都給我打回去,那不是永遠跑不完了么??所以設置GOTO step1之後,還需要在最下面的框里,告訴我循環多少次,比如35次。
這樣,在第36次系統運行到這個步驟的時候,這個步驟的GOTO函數就會把系統放行到下一個步驟了。至此,這套循環執行完畢。
提出這種問題的小朋友應該是沒有編程經驗,對基本的原理想不清楚。要是有點編程的經驗,這個設置應該是很容易理解的。
⑨ 請問 新引物怎樣設置梯度PCR啊
根據引物Tm值(Na+:50mM),兩條引物有2個Tm值,一般建議低於較低Tm值的5~10℃,但實際上問題不是非常大,只要不是GC含量過高或過低的引物或非常難擴增的片段,Tm值不會影響太多。
另外,梯度PCR需要使用的PCR儀具有梯度功能,至於怎樣設置,不同的PCR儀不一樣,請參考對應的儀器說明書。