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阀门ORF指什么

发布时间:2021-10-23 20:20:56

『壹』 什么是开放阅读框(Open Reading Frame, ORF)

在构成基因的核苷酸序列中存在着一些最终翻译成蛋白的碱基段,每三个连续碱基(即三联“ 密码子”) 编码相应的氨基酸。其中有一个起始“密码子”--AUG/ATG和三个终止“ 密码子”,终止“ 密码子”提供 终止信号。当细胞机器沿着核酸合成蛋白链并使其不断延伸的过程中遇到终密码子时,蛋白的延伸反应终止,一个成熟(或提前终止的突变)蛋白产生。因此开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的 碱基序列。由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白。 现在有很多找ORF的软件,包括在线的,如: ORF Finding的功能 ORF Finding 被用来预测已存在的编码区的小基因序列。它较早应于序列设计,应用优于长片断、高质量的匹配。进而,它提供了比用标准基因编码查询更有用的信息。ORF Finding 把提交序列分成六个亚区,并对这六个阅读框分别进行默认,赋予每个亚区一个确定其编码内容的度量, 如果可能,将对每一亚区进行进一步分析。每个亚区按照已有的分类结果,被随机提交给查找它们是否编码 蛋白质的特定测试收集器。最后只有那些具有编码潜能的重要区域才被报导。ORF Finding 识别是证明一个新的DNA序列编码特定的蛋白质的部分或全部的先决条件,可用于大规模的开放式阅读框寻找。 使用说明测试过程:当一个基因被识别、其DNA序列被解读时,人们往往仍然无法 弄清相应的蛋白序列是什么。这是因为在没有其它信息的前提下,DNA序列可以按六种框架阅读和翻译 (每条链三种,对应三种不同的起始密码子)。 ORF Finding 针对小基因序列,搜索并报导可能的蛋白质编码区,它检测这六个阅读框架,并寻找以启动子和 终止子为界限的DNA序列,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。 ORF Finding 通过如下方式处理您的序列: ·定位六个阅读框上的ORF候选区域 ·对每个候选区域的编码可能性进行评估 ·如果可能性很高,就把该区域作为可能的蛋白质编码区进行报导 编码可能性:是通过从物种训练模拟器收集来的统计数据确定的用。ORF Finding 进行蛋白质编码区的预测,有三步程序。 第一步:延伸无终止密码子的序列,把延伸的片断定位在六个阅读框上;它们是下一步进行 开放式阅读框研究的候选序列。 第二步:用物种hexamer统计表来估算ORF候选区域上蛋白质编码部分编码蛋白质的最大可能性。 第三步:根据序列结构和区域最可能成分来计算蛋白质编码的可能性。 这种测试利用物种的统计学原理把编码区从非编码区区分出来,其中包括编码蛋白质的最大可能性的估算、3 个过程的测试 和 ORF片断大小的确定。这种测试应用于物种的二次形式,得到一个三个自由度的 chi-square统计量,被称为候选ORF的二次判别式。这个判别式对于编码区趋向于取大值,对于非编码区 趋向于小值,并被固定化,所以非编码区获取的值趋向于小于1。 一般通过第一步和第二步,大约61%的非编码区域产生值小于1的二次判别式。89%的区域的期望值小于2。 经多次应用发现,5.0的结果很理想,它是介于正、误之间的阈值。 使用方法: 首先选择你测试的序列的来源(物种),然后直接在输入 框内填写您的DNA序列,进行提交即可。但输入序列的长度不得小于50bp。 结果说明:提供最优的潜在开放阅读框位置。通常, ORF Finding 会把您提交的序列进行检测,然后根据阅读框的次序(+1,+2, +3,-1,-2,-3),给出各阅读框架的蛋白质编码区域的 详细信息。如果同一个阅读框包含几个蛋白质编码区域的话,则这一开放式阅读框中蛋白质编码区域 会按照它们的起始核苷酸在该阅读框上的碱基位置依次给出。编码区域的详细信息包括: ·Numb x: 编码区编号。从1依次增加,从此您可以知道各编码区的相对序号和您提交的序列的总编码区数目。 ·Predicted start、Predicted end: 预测的基因编码区的开始、结束。是指该阅读框的该编码区上编码蛋白质的核苷酸的起始和结束位置。 ·Reading frame:阅读框。六种框架(每条链三种,对应三种不同的起始密码子)中的哪一种。 ·Type:类型。说明这一蛋白质编码区是预测出来的还是存在的。 ·ORF start、ORF end:开放式阅读开始、结束。即这一编码区的起始和结束。它除包括编码蛋白质的核酸序列外,还包括调控基因、起始密码子、终止密码子等。 ·Spectral:吸收光谱。 该段核苷酸的吸收光谱数。 ·ORF length:ORF长度。 ·Max likelihood:最大可能性。请参考 测试过程 中的 编码可能性。 MLE length score:最大可能性估量长度评估。即该编码区上编码部分占整个ORF区的比例。 ·Quadratic discriminant:二次判别式的值。对于编码区趋向于取大值,非编码区趋向于取小值

『贰』 什么是ORF

开放阅读框(Open Reading Frame, ORF),某些人认为这是分子病理学领域中最孤独的首位字母缩写名词。在构成基因的核苷酸序列中存在一些最终翻译成蛋白的碱基段。每三个连续碱基,名为三联“密码子”——编码相应的氨基酸(氨基酸是构成蛋白的基本单位)。有三个“密码子”提供终止信号,也就是说,当从DNA和RNA合成蛋白链并使其不断延伸的细胞机器遇到代表终止的“密码子”时,蛋白的延伸反应终止,一个成熟(或提前终止的突变蛋白)产生。因此开放阅读框是DNA上的一段碱基序列,由于拥有特殊的起始密码子和直到可以从该段碱基序列产生合适大小蛋白才出现的终止密码子,该段碱基序列编码一个蛋白。

『叁』 CO乚ORF乚中文念什么

回答和翻译如下:
colorful.
多彩的。
(音译:卡乐佛。)

『肆』 多外显子的基因的ORF包含所有的外显子吗还是指其中的单个外显子

orf只是mRNA中的一段,而mRNA则由多个外显子组成,所以不是所有,当然可能是其中某个,也可能是多个外显子片段,或是部分的外显子吧

『伍』 建筑工程电气图中ORF代表什么意思

BV-10*1.5SC25CC/AX;直径25的线管穿10根1.5的单股铜芯线

『陆』 Cds和ORF的区别是什么

一、功能不同

1、cds:缩短请求响应时间和网络延迟,减轻网站服务器的负载;有效规避信用风险。

2、ORF:降低了所要通告的前缀数量,从而减少BGP路由更新数量;减轻本地路由器工作量。

二、原理不同

1、cds:在计算机上,通过此种服务使各地的Internet客户在访问这些网站时,可以访问最接近本地缓存服务器中缓存的内容;在一定期限内,买卖双方就指定的信用事件进行风险转换的一个合约。信用风险保护的买方在合约期限内或在信用事件发生前定期向信用风险保护的卖方就某个参照实体的信用事件支付费用,以换取信用事件发生后的赔付。

2、ORF:将本地配置的BGP(边界网关协议)前缀过滤器“推送”给远程对等体,以便远程对等体将收到的过滤器应用为自己的又一出站过滤器。

三、特点不同

1、cds:CDS的主要特点是高杠杆性。与购买债券不同,前期投资CDS不需要或仅需要少许资金投入,原因之一就是保护买方仅需要按季度支付票息,而保护卖方只需要保证金账户(margin account)。 CDS的买卖不受债券供应的限制。因此在市场上CDS的名义本金远远要超过标的资产的本金。

2、ORF:ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以起始密码子和终止密码子为界限的DNA序列而其内部不包含起始密码子或终止密码子,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。

『柒』 asco阀门铭牌中英文什么意思

II2D ExtDA21 IP65和II2G ExdIIB+H2指的是用在粉尘和气体的防爆等级以及防护等级,T amb/T cable这个指的是不同的温度组别所适用的温度范围,MEDIUM指的是介质,bar指的是工作压力 ,ORF指的是通经,VOLTS指的是电压, HZ指的是频率,WATTS指的是功耗,pipie指的是接口尺寸,线面那个是型号。

『捌』 基因的cds和orf的区别

CDS特指cDNA上面可以编码蛋白质那段序列。
ORF是指某一段DNA上面有可能编码蛋白质的序列。

『玖』 分子生物学中的CD是指什么ORF又是什么

CD分子是白细胞分化抗原。80年代以来,由于单克隆抗体、分子克隆、基因转染细胞系等技术在白细胞分化抗原研究中得到广泛深入的应用,有关白细胞分化抗原的研究和应用进展相当迅速。在世界卫生组织(WHO)和国际免疫学会联合会(IUIS)的组织下,自1982年至1993年先后举行了五次有关白细胞分化抗原的国际学术讨论会。并应用以单克隆抗体鉴定为主的聚类分析法,将识别同一分化抗原的来自不同实验室的单克隆抗体归为一个分化群(cluster of differentiation,CD)。在许多场合下,抗体及其识别的相应抗原都用同一个CD序号
orf是开放阅读框。开放阅读框是基因序列的一部分,包含一段可以编码蛋白的碱基序列,不能被终止子打断。当一个新基因被识别,其DNA序列被解读,人们仍旧无法搞清相应的蛋白序列是什麽。这是因为在没有其它信息的前提下,DNA序列可以按六种框架阅读和翻译(每条链三种,对应三种不同的起始密码子)。ORF识别包括检测这六个阅读框架并决定哪一个包含以启动子和终止子为界限的DNA序列而其内部不包含启动子或密码子,符合这些条件的序列有可能对应一个真正的单一的基因产物。ORF的识别是证明一个新的DNA序列为特定的蛋白质编码基因的部分或全部的先决条件。

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